Virtual Structural Biology Group » Учебные курсы » Структурная биоинформатика в ВШЭ

h1. Вопросы к экзамену

# * Волновая функция
# * Точное решение уравнения Шредингера Одно-электронный атом
# * Базисные наборы
# * Молекулярная механика Простое уравнение силового поля
# * Martini
# * Электростатические взаимодействия. Двойное обрезание Суммирование Эвальда
# * Ван-дер-Ваальсовы взаимодействия Взаимодействия между разными типами атомов
# * Молекулярная динамика Алгоритмы интегратора
# * Периодические граничные условия
# * Температура Контроль давления в системе
# * Гибридное QM/ММ моделирование
# * Коллективные перемеренные
# * Метадинамика
# * Моделирование отжига
# * Сравнительное моделирование
# * Степень идентичности и сравнительное моделирование
# * Предсказание структуры белка Ab initio
# * Термодинамическая пертурбация
# * Потенциал средней силы
# * Линейное представление молекул, SMILES
# * SMARTS: паттерны для SMILES
# * Фрагментарное построение лиганда
# * QSAR, количественные соотношения структура/ активность
# * Докинг белок-низкомолеклярный лиганд
# * Белковый докинг
# * Элементы вторичной структуры РНК
# * Моделирование хроматина