Virtual Structural Biology Group » Учебные курсы » Структурная биоинформатика в ВШЭ

h1. Вопросы к экзамену

# Волновая функция

# Точное решение уравнения Шредингера Одно-электронный атом

# Базисные наборы

# Молекулярная механика Простое уравнение силового поля

# Martini

# Электростатические взаимодействия. Двойное обрезание Суммирование Эвальда

# Ван-дер-Ваальсовы взаимодействия Взаимодействия между разными типами атомов

# Молекулярная динамика Алгоритмы интегратора

# Периодические граничные условия

# Температура Контроль давления в системе

# Гибридное QM/ММ моделирование

# Коллективные перемеренные

# Метадинамика

# Моделирование отжига

# Сравнительное моделирование

# Степень идентичности и сравнительное моделирование

# Предсказание структуры белка Ab initio

# Термодинамическая пертурбация

# Потенциал средней силы

# Линейное представление молекул, SMILES

# SMARTS: паттерны для SMILES

# Фрагментарное построение лиганда

# QSAR, количественные соотношения структура/ активность

# Докинг белок-низкомолеклярный лиганд

# Белковый докинг

# Элементы вторичной структуры РНК

# Моделирование хроматина