Activity

From 19.06.2021 to 18.07.2021

12:12 Пептиды Study #440 (New): Литературный обзор: * Какие цели преследуют химические модификации пептидов, с какой успешностью.
* Какие известны истории успеха (в пе... Alexander Zlobin
12:09 Пептиды Study #439 (New): Подготовка к работе: Краткое описание наших ресурсов
https://docs.google.com/document/d/1gvLNjjTxObEgTHGwiGfsFFq418UBWSJzjmsBdd4dShI/edit... Alexander Zlobin
11:49 Пептиды Project #438 (New): Рациональный дизайн пептидомиметиков: Хотим иметь инструмент:
* На вход получает PDB структуры комплекса рецептор-пептид
* На выход генерирует структ... Alexander Zlobin
11:27 Фосфоглицерат мутаза Study #435 (New): Подготовка к работе: До 15 августа
1) Собрать подборку статей о структуре и функциях фосфоглицератмутазы. Особое внимание обратить на то,... Alexander Zlobin

19:59 Киназы антибиотикорезистентности Exploration #406: Отбор систем-кандидатов (предреакционное состояние): 1) RMSD только по тяжелым атомам хвоста трифосфата (AMP-PNP): вкладка amp-pnp-3p-tail,
2) RMSD только по тяжелым ато... July Belyaeva
17:04 Киназы антибиотикорезистентности Exploration #406: Отбор систем-кандидатов (предреакционное состояние): У нас есть 120 систем по 5 реплик на каждую. Это очень много данных, и теперь нам предстоит непростая задача - найти ... Alexander Zlobin

09:41 A17 Project #410: Улучшение А17: Нужно поставить на холд и попробовать посчитать реакции в киназе и фосфатазе. Это заявка на отдельный проект, вероятн... Alexander Zlobin
09:40 A17 Soft #425 (Resolved): Собрать старый интерфейс на риппере: Все работает, использую, спасибо! Alexander Zlobin
09:39 A17 Exploration #390 (Closed): Проблема с SCC в Gromacs-DFTB+ на реакции с параоксоном: Главная гипотеза на данный момент - такая реакция вовсе не может идти, потому и идет взрыв. Вероятно, тирозин депрото... Alexander Zlobin

13:29 Киназы антибиотикорезистентности Production #397: Подготовка систем: Для систем подготовлены sys.ndx и posre.itp July Belyaeva

23:10 Киназы антибиотикорезистентности Production #397: Подготовка систем: *Пересобранные системы лежат по следующему пути*:
/home/domain/data/julybel/amin-2021/AMP-PMP/systems/
.gro каждо... July Belyaeva
15:07 Киназы антибиотикорезистентности Production #397: Подготовка систем: Есть системы, где неверное число атомов в GRO, также есть системы с неверно расположенным АТФ. Насколько это одни и т... Alexander Zlobin

Also available in: Atom