Activity

From 17.08.2021 to 15.09.2021

09:56 Фосфоглицерат мутаза Production #450 (In Progress): Стартовые системы: Подготовить стартовую систему комплекса PGM c двумя вариантами субстратов. Под стартовой системой подразумевается зал... Alexander Zlobin
09:47 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе: В этом таске все же стоит попытаться найти хоть что-то про стереоселективность. Это могут быть очень древние статьи, ... Alexander Zlobin

01:36 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе: Только начнешь жаловаться, что все уже прочитал, так сразу что-нибудь находится еще. Но все равно не то.
_"Cofactor-... Anastasia Rachkova
00:43 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе: _"The Design and Synthesis of N-Xanthone Benzenesulfonamides as Novel Phosphoglycerate Mutase 1 (PGAM1) Inhibitors"(2... Anastasia Rachkova
15:27 Плазмин Production #448: Стартовые системы: Результаты альфафолда. Забавно, что он фолдит стрептокиназу прямо как в кристалле, при том, что плазмин отсутствует. ... Alexander Zlobin

17:58 Плазмин Production #448: Стартовые системы: Сделал стартовую систему. Лежит в папке home/domain/egor22366/plasmin/1_model_solv_ions.gro. В качетве mdp файла взял... Egor Ilin

19:19 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе: Пройти второй туториал и поискать статьи про стереоизомеры в активном центре фермента Anastasia Rachkova
19:17 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе: Освоила статьи про моделирование и первый туториал громакса. Anastasia Rachkova

19:02 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе: Про фосфорилирование 26 Тирозина:
_"Molecular dynamics simulation reveals how phosphorylation of tyrosine 26 of phos... Anastasia Rachkova

11:05 Плазмин Study #447: Подготовка к работе: https://go.drugbank.com/drugs/DB00086
"Streptokinase creates an active complex which promotes the cleavage of the ... Alexander Zlobin
10:57 Плазмин Production #448: Стартовые системы: Комплекс плазмина со стрептокиназой: 1BML (NB: Это неактивный искусственный мутант по кат. серину, S>A, надо вернуть ... Alexander Zlobin

21:47 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе: "Structure and mechanism of action of a novel phosphoglycerate mutase from Bacillus stearothermophilus" - про iPGM, у... Anastasia Rachkova
11:23 Плазмин Production #448 (In Progress): Стартовые системы: Необходимо
1) Собрать все кристаллы плазмина и плазминогена на данный момент
2) Отсортировать по тому, что это за ф... Alexander Zlobin
11:20 Плазмин Study #447 (New): Подготовка к работе: До 15 сентября
1) Собрать подборку статей о структуре и функциях плазмина и том, что известно о его активации. Особо... Alexander Zlobin
11:17 Плазмин Project #446 (New): Байндинг-активация плазмина: Плазминоген должен быть связан сначала одним из байндинг-активаторов (фибрин, стрепто/стафилокиназа, рецептор урокина... Alexander Zlobin

17:25 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе: Сейчас буду проходить туториалы.
#Еще ссылки на статьи, чтобы не потерялись.
https://www.researchgate.net/publicati... Anastasia Rachkova
17:22 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе: Собрала подборку статей (разных лет, с 1980-ых до 2010-ых), из того, что пока нашла - молекулярное моделирование пров... Anastasia Rachkova
14:16 Киназы антибиотикорезистентности Production #397 (Resolved): Подготовка систем: Alexander Zlobin
14:14 Киназы антибиотикорезистентности Production #395 (Resolved): Параметризация AMP-PNP: Alexander Zlobin
14:14 dNTPases Discussion #408 (Closed): Обсудить прошедшую защиту и дальнейшие планы: Alexander Zlobin

Also available in: Atom