Activity

From 18.06.2021 to 17.07.2021

19:59 Киназы антибиотикорезистентности Exploration #406: Отбор систем-кандидатов (предреакционное состояние): 1) RMSD только по тяжелым атомам хвоста трифосфата (AMP-PNP): вкладка amp-pnp-3p-tail,
2) RMSD только по тяжелым ато... July Belyaeva
17:04 Киназы антибиотикорезистентности Exploration #406: Отбор систем-кандидатов (предреакционное состояние): У нас есть 120 систем по 5 реплик на каждую. Это очень много данных, и теперь нам предстоит непростая задача - найти ... Alexander Zlobin

09:41 A17 Project #410: Улучшение А17: Нужно поставить на холд и попробовать посчитать реакции в киназе и фосфатазе. Это заявка на отдельный проект, вероятн... Alexander Zlobin
09:40 A17 Soft #425 (Resolved): Собрать старый интерфейс на риппере: Все работает, использую, спасибо! Alexander Zlobin
09:39 A17 Exploration #390 (Closed): Проблема с SCC в Gromacs-DFTB+ на реакции с параоксоном: Главная гипотеза на данный момент - такая реакция вовсе не может идти, потому и идет взрыв. Вероятно, тирозин депрото... Alexander Zlobin

13:29 Киназы антибиотикорезистентности Production #397: Подготовка систем: Для систем подготовлены sys.ndx и posre.itp July Belyaeva

23:10 Киназы антибиотикорезистентности Production #397: Подготовка систем: *Пересобранные системы лежат по следующему пути*:
/home/domain/data/julybel/amin-2021/AMP-PMP/systems/
.gro каждо... July Belyaeva
15:07 Киназы антибиотикорезистентности Production #397: Подготовка систем: Есть системы, где неверное число атомов в GRO, также есть системы с неверно расположенным АТФ. Насколько это одни и т... Alexander Zlobin

11:47 A17 Exploration #390: Проблема с SCC в Gromacs-DFTB+ на реакции с параоксоном: Расчеты для ASP/GLU теозима почти завершены, ориентировочно еще 2 дня. К понедельнику - финализировать набор теозимов... Alexander Zlobin

Also available in: Atom