Activity

From 04.05.2021 to 02.06.2021

17:09 Production #395: Параметризация AMP-PNP: *Пути до файлов с топологией*:
1) /home/domain/data/julybel/amin-2021/AMP-PMP/amp-pnp/parameterize/parameters/GAFF2/... July Belyaeva
16:56 Production #395: Параметризация AMP-PNP: *Слияние топологий*:
- в файле /home/domain/data/julybel/amin-2021/AMP-PMP/*amp-pnp*/parameterize/parameters/GAFF2/m... July Belyaeva
12:11 Production #395: Параметризация AMP-PNP: *Запуск parameterize для amp-pnp и amp-pnph производится со следующими параметрами*:
> parameterize Mol_m1-o1.mol2 -... July Belyaeva

16:14 Production #420 (New): Динамики с ATP: Нужно подготовить системы и прогнать динамики с ATP и его протонированными вариантами. Alexander Zlobin
16:12 Project #419 (New): Второй металл и протоны в AmiN: По механизму работы AmiN киназы остались вопросы. Так, не понятно, почему не связывается второй металл (или связывает... Alexander Zlobin
12:22 Production #395 (In Progress): Параметризация AMP-PNP: July Belyaeva

20:21 Production #395: Параметризация AMP-PNP: h3. Шаги работы для получения зарядов
1. Структуры AMP-PNP, AMP-PNP-h, и двух хвостов нарисовать в авогадро. Присв... Alexander Zlobin
14:28 Production #395: Параметризация AMP-PNP: Нужно дополнительное напоминание о процедуре запуска *RESP* (ранее этого не делала) на одном примере.
Также нужны... July Belyaeva
14:56 Exploration #406 (In Progress): Отбор систем-кандидатов (предреакционное состояние): Была написана функция, которая обрабатывает pdb-файлы посчитанных 60 систем и считает для них ряд геометрических пара... July Belyaeva

Also available in: Atom