Activity

From 16.04.2021 to 15.05.2021

12:16 Exploration #390: Проблема с SCC в Gromacs-DFTB+ на реакции с параоксоном: Дублирование связей и углов не помогло в реальной системе Alexander Zlobin

16:50 Exploration #390: Проблема с SCC в Gromacs-DFTB+ на реакции с параоксоном: D-орбиталь азота ничего не изменила, быстрое падение. Alexander Zlobin
15:17 Exploration #390: Проблема с SCC в Gromacs-DFTB+ на реакции с параоксоном: BREAKING NEWS
Дублирование связей и углов из механики для части квантовой системы (от мостикового кислорода до нитро... Alexander Zlobin
14:53 Exploration #390: Проблема с SCC в Gromacs-DFTB+ на реакции с параоксоном: 1) Принял в работу
2) Нет, падение не сопровождается отслеживаемыми глазом геометрическими событиями
Допишу также... Alexander Zlobin

12:43 Exploration #390: Проблема с SCC в Gromacs-DFTB+ на реакции с параоксоном: 1) Есть смысл проверить MaxAngularMomentum = d для азота?
2) Падение происходит при образовании PNP иона? Andrey Golovin

17:41 Exploration #390: Проблема с SCC в Gromacs-DFTB+ на реакции с параоксоном: Итак, что-то явно происходит особенное с параоксоном - ДФП работает отлично, реакция проходит шикарно.
Параллельн... Alexander Zlobin

11:33 Exploration #390: Проблема с SCC в Gromacs-DFTB+ на реакции с параоксоном: Саша, на всякий случай укажите директорию где вы это делаете. Для горизонтальной передачи знаний. Andrey Golovin

18:52 Exploration #390 (In Progress): Проблема с SCC в Gromacs-DFTB+ на реакции с параоксоном: Alexander Zlobin

17:10 Exploration #390: Проблема с SCC в Gromacs-DFTB+ на реакции с параоксоном: Note: формально это не часть проекта РНФ-абзим, это часть РФФИ-Сириус. Однако статейно конечно в любом случае подходи... Alexander Zlobin
17:04 Exploration #390: Проблема с SCC в Gromacs-DFTB+ на реакции с параоксоном: Лог от 30.04.2021. АЗло
Какие варианты были проработаны:
1. Отличие GMX-DFTB от GMX-DFTB+
1 ходок в GMX-DFTB п... Alexander Zlobin
16:33 Exploration #390 (Closed): Проблема с SCC в Gromacs-DFTB+ на реакции с параоксоном: GMX-DFTB+ не может стабильно считать реакцию с параоксоном в системе тирозин-глутамат. Задача этого проекта - максима... Andrey Golovin

Also available in: Atom