Virtual Structural Biology Group » Учебные курсы

h1. Визуализация научных данных

h2. Преподаватели

Андрей Головин, к.х.н., старший преподаватель факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ
E-mail: golovin@genebee.msu.ru

Решетников Роман, к.ф-м.н., научный сотрудник ИБГ РАН
E-mail: r.reshetnikov@gmail.com

Залевский Артур, студент факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ
E-mail: aozalevsky@fbb.msu.ru

{{toc}}

h2. Цели курса

# Рассказать об общепринятых методах работы с массивами научных данных
# Продемонстрировать удачные образцы иллюстраций к научным работам
# Познакомить с инструментами для создания высококачественных иллюстраций



h2. Программа курса

* Введение:
1. Вводная лекция, знакомство с PyMol.
* # Визуализация 3х мерных структур:
2. структур, создание анимированных роликов. Банк PDB. Работа в PyMol.
3. Анимация и создание видео в PyMol. Blender.
* # Физиология восприятия информации:
4. Законы Вебера и Стивенса. Шкала Кливленда. Теория контраста. информации.
* Графики:
5. # Типы графиков и особенности их применения.
6. Введение в обработку Обработка цифровых сигналов. Работа в gnuplot (R). gnuplot. R.
* # Диаграммы, схемы, деревья.
7. Диаграммы, интерактивные схемы. Graphviz, yEd, Graphviz. Gephi.
8. Деревья, геномные данные. figtree, Circos. yEd.
# Лицензии, банки иллюстраций.
* Векторная и растровая графика:
9. # Работа с векторной графикой. Верстка постера в графикой, верстка постеров. Inkscape.
* Дополнительные главы:
10. Лицензии, банки иллюстраций. Приглашенный докладчик.
11. Продвинутая визуализация 3х мерных структур. Blender.
* Зачет:
12. Выполнение зачетного задания.



h2. Презентации к лекциям

Будут выкладываться по мере прохождения занятий *Лекция 1.*

h2. Домашние задания

h2. Задания

Будут выкладываться по мере прохождения занятий

h2. Как выставляется итоговая оценка по курсу



Необходимо выполнить все задания и сдать зачетное задание.



h2. Примеры работ

!{width: 400px; margin: 1em;}lip.png! !{width: 400px; margin: 1em;}thr_fib.png!
!{width: 400px; margin: 1em;}thr_pic.png! !{width: 400px; margin: 1em;}gold-tro-white.png!
!{width: 400px; margin: 1em;}shuffle.png! !{width: 400px; margin: 1em;}duplex_dna_rot.png!



h2. [[Литература]]

Список будет обновляться по мере прохождения занятий