« Previous - Version 22/24 (diff) - Next » - Current version
Arthur Zalevsky, 10.02.2014 10:26


Визуализация научных данных

Преподаватели

Андрей Головин, к.х.н., старший преподаватель факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ
E-mail:

Решетников Роман, к.ф-м.н., научный сотрудник ИБГ РАН
E-mail:

Залевский Артур, студент факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ
E-mail:

Цели курса

  1. Рассказать об общепринятых методах работы с массивами научных данных
  2. Продемонстрировать удачные образцы иллюстраций к научным работам
  3. Познакомить с инструментами для создания высококачественных иллюстраций

Программа курса

  • Введение:
    1. Вводная лекция, знакомство с PyMol.
  • Визуализация 3х мерных структур:
    2. Банк PDB. Работа в PyMol.
    3. Анимация и создание видео в PyMol.
  • Физиология восприятия информации:
    4. Законы Вебера и Стивенса. Шкала Кливленда. Теория контраста.
  • Графики:
    5. Типы графиков и особенности их применения.
    6. Введение в обработку цифровых сигналов. Работа в gnuplot (R).
  • Диаграммы, схемы, деревья.
    7. Диаграммы, схемы. Graphviz, yEd, Gephi.
    8. Деревья, геномные данные. figtree, Circos.
  • Векторная и растровая графика:
    9. Работа с векторной графикой. Верстка постера в Inkscape.
  • Дополнительные главы:
    10. Лицензии, банки иллюстраций. Приглашенный докладчик.
    11. Продвинутая визуализация 3х мерных структур. Blender.
  • Зачет:
    12. Выполнение зачетного задания.

Презентации к лекциям

Будут выкладываться по мере прохождения занятий

Задания

Будут выкладываться по мере прохождения занятий

Как выставляется итоговая оценка по курсу

Необходимо сдать зачетное задание.

Примеры работ



Литература

Список будет обновляться по мере прохождения занятий

lip.png (1.47 MB) Arthur Zalevsky, 16.09.2013 17:21

thr_pic.png (2.84 MB) Arthur Zalevsky, 16.09.2013 17:21

gold-tro-white.png (1.36 MB) Arthur Zalevsky, 16.09.2013 17:25

shuffle.png (1.64 MB) Arthur Zalevsky, 16.09.2013 17:33

dsp.png (209 KB) Arthur Zalevsky, 16.09.2013 17:34

duplex_dna_rot.png (366 KB) Arthur Zalevsky, 16.09.2013 17:39

thr_fib.png (5.72 MB) Arthur Zalevsky, 02.02.2014 13:11