Сириус - фибринолиз » Плазмин

05.11.2021

13:48 Production #448: Стартовые системы

Что-то не так с complex_w.gro
gromacsplugin) Error reading atom 162228 from file, file does not match format
Obj... Alexander Zlobin

04.11.2021

16:29 Production #448: Стартовые системы

Сделал модели белков( плазмин, плазминоген и их комплексы со стрептокиназой). Пока ионы не добавлял, нужен опытный вз... Egor Ilin

28.10.2021

18:25 Project #455 (In Progress): Гидролиз-активация плазмина

Дай, пожалуйста, право на редактирование
Думаю, еще стоит добавить инфу о том, кто из них мутант, кто нет Alexander Zlobin

18:20 Project #455: Гидролиз-активация плазмина

Таблица со структурами плазмина/плазминогена, организм - _Homo sapiens_.
Не ставила ограничений по разрешению, оно у... July Belyaeva

18.10.2021

14:05 Exploration #457 (New): Обзор по гидролазам

Возникла мысль о том, что весьма полезно было бы сделать крупный литературный обзор по гидролазам, который мог бы пом... July Belyaeva

13:59 Production #448: Стартовые системы

Так, супер-важное изменение. В будущем нам надо будет прочекать, какая структура стабильнее -
а) где Н-конец актива... Alexander Zlobin

13:55 Project #455: Гидролиз-активация плазмина

Юля, как договаривались, передаю тебе этот тикет.
Папка, где я делал расчеты:
/home/domain/data/zlobin/2021/plasm... Alexander Zlobin

11.10.2021

18:05 Project #455: Гидролиз-активация плазмина

*Задание на неделю 11-18*
1.1. Посчитать в 3 повторностях динамики плазмина: Nneu-AspH и Nchg-Asp. CHARMM36m ибо в а... Alexander Zlobin

17:28 Project #455 (In Progress): Гидролиз-активация плазмина

Часть отчетной кампании по Сириусу
Хотим пронаблюдать весь процесс между разрезанием активирующей петли и перестро... Alexander Zlobin

10.10.2021

23:05 Production #448: Стартовые системы

/home/domain/egor22366/plasmin/plasmin_sk/plasmin_sk_2/npt.gro
/home/domain/egor22366/plasmin/plasmin_sk/plasmin_sk_... Egor Ilin