Фосфоглицерат мутаза

10.01.2022

19:21 Production #450: Стартовые системы

Для S-изомера все получилось, с ним работала в новой папке
/home/domain/rachkovanastya/PGM_S_start
Anastasia Rachkova

17:59 Production #450: Стартовые системы

Переделала все еще раз, подкорректировала воду, в который сомневалась в прошлый раз. Но снова при запуске gmx mdrun -... Anastasia Rachkova

09.01.2022

02:35 Production #450: Стартовые системы

Что есть:
прочитала статьи.
для R-изомера еще раз заново сделала файл белка, поправила руками Asn, Gln, His. Сделал... Anastasia Rachkova

03.01.2022

15:50 Production #450: Стартовые системы

При выполнении
*gmx grompp -f em.mdp -c 3GP5_ions.gro -p topol.top -o em.tpr*
возникла сдедующая ошибка:
Fatal er... Anastasia Rachkova

29.12.2021

12:13 Production #450: Стартовые системы

Важные моменты:
В файле complex.gro лучше сразу ставить атомы лиганда сразу после белка и перед водой, все атомы дол... Anastasia Rachkova