Visualization

Version 24 (Arthur Zalevsky, 25.03.2014 22:16)

1 1 Arthur Zalevsky
h1. Визуализация научных данных
2 1 Arthur Zalevsky
3 2 Arthur Zalevsky
h2. Преподаватели
4 1 Arthur Zalevsky
5 1 Arthur Zalevsky
Андрей Головин, к.х.н., старший преподаватель факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ
6 1 Arthur Zalevsky
E-mail: golovin@genebee.msu.ru
7 1 Arthur Zalevsky
8 1 Arthur Zalevsky
Решетников Роман, к.ф-м.н., научный сотрудник ИБГ РАН
9 1 Arthur Zalevsky
E-mail: r.reshetnikov@gmail.com
10 1 Arthur Zalevsky
11 1 Arthur Zalevsky
Залевский Артур, студент факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ
12 1 Arthur Zalevsky
E-mail: aozalevsky@fbb.msu.ru
13 1 Arthur Zalevsky
14 1 Arthur Zalevsky
15 2 Arthur Zalevsky
{{toc}}
16 1 Arthur Zalevsky
17 3 Arthur Zalevsky
h2. Цели курса
18 1 Arthur Zalevsky
19 3 Arthur Zalevsky
# Рассказать об общепринятых методах работы с массивами научных данных
20 3 Arthur Zalevsky
# Продемонстрировать удачные образцы иллюстраций к научным работам
21 3 Arthur Zalevsky
# Познакомить с инструментами для создания высококачественных иллюстраций
22 2 Arthur Zalevsky
23 3 Arthur Zalevsky
h2. Программа курса
24 1 Arthur Zalevsky
25 22 Arthur Zalevsky
* Введение:
26 22 Arthur Zalevsky
 1. Вводная лекция, знакомство с PyMol.
27 22 Arthur Zalevsky
* Визуализация 3х мерных структур:
28 22 Arthur Zalevsky
 2. Банк PDB. Работа в PyMol. 
29 22 Arthur Zalevsky
 3. Анимация и создание видео в PyMol.
30 22 Arthur Zalevsky
* Физиология восприятия информации:
31 22 Arthur Zalevsky
 4. Законы Вебера и Стивенса. Шкала Кливленда. Теория контраста.
32 22 Arthur Zalevsky
* Графики:
33 22 Arthur Zalevsky
 5. Типы графиков и особенности их применения. 
34 22 Arthur Zalevsky
 6. Введение в обработку цифровых сигналов. Работа в gnuplot (R).
35 22 Arthur Zalevsky
* Диаграммы, схемы, деревья.
36 22 Arthur Zalevsky
 7. Диаграммы, схемы. Graphviz, yEd, Gephi.
37 22 Arthur Zalevsky
 8. Деревья, геномные данные. figtree, Circos.
38 22 Arthur Zalevsky
* Векторная и растровая графика:
39 22 Arthur Zalevsky
 9. Работа с векторной графикой. Верстка постера в Inkscape.
40 22 Arthur Zalevsky
* Дополнительные главы:
41 22 Arthur Zalevsky
 10. Лицензии, банки иллюстраций. Приглашенный докладчик.
42 22 Arthur Zalevsky
 11. Продвинутая визуализация 3х мерных структур. Blender.
43 22 Arthur Zalevsky
* Зачет:
44 22 Arthur Zalevsky
 12. Выполнение зачетного задания.
45 1 Arthur Zalevsky
46 1 Arthur Zalevsky
h2. Презентации к лекциям
47 1 Arthur Zalevsky
48 22 Arthur Zalevsky
Будут выкладываться по мере прохождения занятий
49 1 Arthur Zalevsky
50 1 Arthur Zalevsky
51 22 Arthur Zalevsky
h2. Задания
52 1 Arthur Zalevsky
53 22 Arthur Zalevsky
Будут выкладываться по мере прохождения занятий
54 4 Arthur Zalevsky
55 1 Arthur Zalevsky
h2. Как выставляется итоговая оценка по курсу
56 1 Arthur Zalevsky
57 22 Arthur Zalevsky
Необходимо сдать зачетное задание.
58 1 Arthur Zalevsky
59 23 Arthur Zalevsky
h2. [[Gallery|Примеры работ]]
60 1 Arthur Zalevsky
61 1 Arthur Zalevsky
h2. [[Литература]]
62 24 Arthur Zalevsky
63 24 Arthur Zalevsky
h2. [[add_materials|Дополнительные материалы]]
64 22 Arthur Zalevsky
65 22 Arthur Zalevsky
Список будет обновляться по мере прохождения занятий