Edit History

Wiki »

Visualization

Version 22 (Arthur Zalevsky, 10.02.2014 10:26)

1 1 Arthur Zalevsky 
h1. Визуализация научных данных
2 1 Arthur Zalevsky 





    3
    2
    Arthur Zalevsky
    
h2. Преподаватели





    4
    1
    Arthur Zalevsky
    





    5
    1
    Arthur Zalevsky
    
Андрей Головин, к.х.н., старший преподаватель факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ





    6
    1
    Arthur Zalevsky
    
E-mail: golovin@genebee.msu.ru





    7
    1
    Arthur Zalevsky
    





    8
    1
    Arthur Zalevsky
    
Решетников Роман, к.ф-м.н., научный сотрудник ИБГ РАН





    9
    1
    Arthur Zalevsky
    
E-mail: r.reshetnikov@gmail.com





    10
    1
    Arthur Zalevsky
    





    11
    1
    Arthur Zalevsky
    
Залевский Артур, студент факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ





    12
    1
    Arthur Zalevsky
    
E-mail: aozalevsky@fbb.msu.ru





    13
    1
    Arthur Zalevsky
    





    14
    1
    Arthur Zalevsky
    





    15
    2
    Arthur Zalevsky
    
{{toc}}





    16
    1
    Arthur Zalevsky
    





    17
    3
    Arthur Zalevsky
    
h2. Цели курса





    18
    1
    Arthur Zalevsky
    





    19
    3
    Arthur Zalevsky
    
# Рассказать об общепринятых методах работы с массивами научных данных





    20
    3
    Arthur Zalevsky
    
# Продемонстрировать удачные образцы иллюстраций к научным работам





    21
    3
    Arthur Zalevsky
    
# Познакомить с инструментами для создания высококачественных иллюстраций





    22
    2
    Arthur Zalevsky
    





    23
    3
    Arthur Zalevsky
    
h2. Программа курса





    24
    1
    Arthur Zalevsky
    





    25
    22
    Arthur Zalevsky
    
* Введение:





    26
    22
    Arthur Zalevsky
    
 1. Вводная лекция, знакомство с PyMol.





    27
    22
    Arthur Zalevsky
    
* Визуализация 3х мерных структур:





    28
    22
    Arthur Zalevsky
    
 2. Банк PDB. Работа в PyMol. 





    29
    22
    Arthur Zalevsky
    
 3. Анимация и создание видео в PyMol.





    30
    22
    Arthur Zalevsky
    
* Физиология восприятия информации:





    31
    22
    Arthur Zalevsky
    
 4. Законы Вебера и Стивенса. Шкала Кливленда. Теория контраста.





    32
    22
    Arthur Zalevsky
    
* Графики:





    33
    22
    Arthur Zalevsky
    
 5. Типы графиков и особенности их применения. 





    34
    22
    Arthur Zalevsky
    
 6. Введение в обработку цифровых сигналов. Работа в gnuplot (R).





    35
    22
    Arthur Zalevsky
    
* Диаграммы, схемы, деревья.





    36
    22
    Arthur Zalevsky
    
 7. Диаграммы, схемы. Graphviz, yEd, Gephi.





    37
    22
    Arthur Zalevsky
    
 8. Деревья, геномные данные. figtree, Circos.





    38
    22
    Arthur Zalevsky
    
* Векторная и растровая графика:





    39
    22
    Arthur Zalevsky
    
 9. Работа с векторной графикой. Верстка постера в Inkscape.





    40
    22
    Arthur Zalevsky
    
* Дополнительные главы:





    41
    22
    Arthur Zalevsky
    
 10. Лицензии, банки иллюстраций. Приглашенный докладчик.





    42
    22
    Arthur Zalevsky
    
 11. Продвинутая визуализация 3х мерных структур. Blender.





    43
    22
    Arthur Zalevsky
    
* Зачет:





    44
    22
    Arthur Zalevsky
    
 12. Выполнение зачетного задания.





    45
    1
    Arthur Zalevsky
    





    46
    1
    Arthur Zalevsky
    
h2. Презентации к лекциям





    47
    1
    Arthur Zalevsky
    





    48
    22
    Arthur Zalevsky
    
Будут выкладываться по мере прохождения занятий





    49
    1
    Arthur Zalevsky
    





    50
    1
    Arthur Zalevsky
    





    51
    22
    Arthur Zalevsky
    
h2. Задания





    52
    1
    Arthur Zalevsky
    





    53
    22
    Arthur Zalevsky
    
Будут выкладываться по мере прохождения занятий





    54
    4
    Arthur Zalevsky
    





    55
    1
    Arthur Zalevsky
    
h2. Как выставляется итоговая оценка по курсу





    56
    1
    Arthur Zalevsky
    





    57
    22
    Arthur Zalevsky
    
Необходимо сдать зачетное задание.





    58
    1
    Arthur Zalevsky
    





    59
    1
    Arthur Zalevsky
    
h2. Примеры работ





    60
    2
    Arthur Zalevsky
    





    61
    19
    Arthur Zalevsky
    
!{width: 400px; margin: 1em;}lip.png! !{width: 400px; margin: 1em;}thr_fib.png!





    62
    1
    Arthur Zalevsky
    
!{width: 400px; margin: 1em;}thr_pic.png! !{width: 400px; margin: 1em;}gold-tro-white.png! 





    63
    19
    Arthur Zalevsky
    
!{width: 400px; margin: 1em;}shuffle.png! !{width: 400px; margin: 1em;}duplex_dna_rot.png!





    64
    20
    Arthur Zalevsky
    





    65
    19
    Arthur Zalevsky
    
h2. [[Литература]]





    66
    22
    Arthur Zalevsky
    





    67
    22
    Arthur Zalevsky
    
Список будет обновляться по мере прохождения занятий