Lom

Version 1 (Andrey Golovin, 15.11.2013 16:46)

1 1 Andrey Golovin
h1. Ломоносов
2 1 Andrey Golovin
3 1 Andrey Golovin
* В корне есть директория *_scratch* запус программ надо делать в этой директории.
4 1 Andrey Golovin
* Интересные директории с предустановленными программам можно найти в */opt* Например:
5 1 Andrey Golovin
6 1 Andrey Golovin
<pre>
7 1 Andrey Golovin
ls /opt
8 1 Andrey Golovin
baqus    Accelrys.old  ccoe  cuda-5.0  dislib    install  mellanox     molpro2010.1       mpi  nmon  octo     pathscale  pdde      pgi             software  toolworks  VRTSpbx  xcat
9 1 Andrey Golovin
Accelrys  acml5.3.0     cuda  dimonta   distribs  intel    modulefiles  molpro2010.1.orig  MS   nvc   old-opt  pdag       pdshared  pgi-backup.tgz  Symantec  VASP       wien2k
10 1 Andrey Golovin
</pre>
11 1 Andrey Golovin
12 1 Andrey Golovin
<pre>
13 1 Andrey Golovin
ls /opt/software
14 1 Andrey Golovin
DL_POLY  FF8  FlowVision  ga-5-1  Gromacs  netCDF  OpenFOAM  openfoam-2.1  OpenFOAM-2.1  OpenFOAM-2.1.1-impi41  openfoam-2.2  OpenFOAM-2.2  TURBOMOLE  wrapper
15 1 Andrey Golovin
</pre>
16 1 Andrey Golovin
17 1 Andrey Golovin
* Сборка Gromacs:
18 1 Andrey Golovin
** Надо зайти на <pre><ssh compiler/pre>
19 1 Andrey Golovin
** Задать параметры компилятора и mpi 
20 1 Andrey Golovin
<pre>
21 1 Andrey Golovin
└─> module load 
22 1 Andrey Golovin
dot                impi/4.0.3         mkl/4.0.2.146      module-info        null               openmpi/1.5.5-pgi  use.own            
23 1 Andrey Golovin
ekopath/4.0.11     impi/4.1.0-32bit   module-cvs         modules            openmpi/1.5.5-icc  pgi/12.9           
24 1 Andrey Golovin
25 1 Andrey Golovin
└─> module list 
26 1 Andrey Golovin
Currently Loaded Modulefiles:
27 1 Andrey Golovin
  1) impi/4.1.0          2) intel/13.1.0        3) cuda/5.0.35       
28 1 Andrey Golovin
</pre>