Lom
Version 1 (Andrey Golovin, 15.11.2013 16:46)
1 | 1 | Andrey Golovin | h1. Ломоносов |
---|---|---|---|
2 | 1 | Andrey Golovin | |
3 | 1 | Andrey Golovin | * В корне есть директория *_scratch* запус программ надо делать в этой директории. |
4 | 1 | Andrey Golovin | * Интересные директории с предустановленными программам можно найти в */opt* Например: |
5 | 1 | Andrey Golovin | |
6 | 1 | Andrey Golovin | <pre> |
7 | 1 | Andrey Golovin | ls /opt |
8 | 1 | Andrey Golovin | baqus Accelrys.old ccoe cuda-5.0 dislib install mellanox molpro2010.1 mpi nmon octo pathscale pdde pgi software toolworks VRTSpbx xcat |
9 | 1 | Andrey Golovin | Accelrys acml5.3.0 cuda dimonta distribs intel modulefiles molpro2010.1.orig MS nvc old-opt pdag pdshared pgi-backup.tgz Symantec VASP wien2k |
10 | 1 | Andrey Golovin | </pre> |
11 | 1 | Andrey Golovin | |
12 | 1 | Andrey Golovin | <pre> |
13 | 1 | Andrey Golovin | ls /opt/software |
14 | 1 | Andrey Golovin | DL_POLY FF8 FlowVision ga-5-1 Gromacs netCDF OpenFOAM openfoam-2.1 OpenFOAM-2.1 OpenFOAM-2.1.1-impi41 openfoam-2.2 OpenFOAM-2.2 TURBOMOLE wrapper |
15 | 1 | Andrey Golovin | </pre> |
16 | 1 | Andrey Golovin | |
17 | 1 | Andrey Golovin | * Сборка Gromacs: |
18 | 1 | Andrey Golovin | ** Надо зайти на <pre><ssh compiler/pre> |
19 | 1 | Andrey Golovin | ** Задать параметры компилятора и mpi |
20 | 1 | Andrey Golovin | <pre> |
21 | 1 | Andrey Golovin | └─> module load |
22 | 1 | Andrey Golovin | dot impi/4.0.3 mkl/4.0.2.146 module-info null openmpi/1.5.5-pgi use.own |
23 | 1 | Andrey Golovin | ekopath/4.0.11 impi/4.1.0-32bit module-cvs modules openmpi/1.5.5-icc pgi/12.9 |
24 | 1 | Andrey Golovin | |
25 | 1 | Andrey Golovin | └─> module list |
26 | 1 | Andrey Golovin | Currently Loaded Modulefiles: |
27 | 1 | Andrey Golovin | 1) impi/4.1.0 2) intel/13.1.0 3) cuda/5.0.35 |
28 | 1 | Andrey Golovin | </pre> |