Вопросы¶

1. Введение в дизайн белков. Интегрирование информации из разных источников. Выявление горячих точек для внесения замен.
2. Принципы дизайна: эволюционный дизайн, рациональный дизайн, комбинаторный дизайн. Принципы работы Rosetta.
3. Дизайн стабильности белков.
4. Дисульфидный инжиниринг. Переупаковка гидрофобных ядер.
5. Повышение термостабильности. Обзор методов предсказания ddG фолдинга при внесении замены.
6. Дизайн карманов связывания малых молекул с учетом динамики.
7. Дизайн хода остова белка. Дизайн петель, инсерций и делеций.
8. Дизайн стабильных белков с заданным ходом остова.
9. Дизайн ферментов. Стабилизация переходного состояния.
10 Теозим.
11. Валидация дизайна ферментов, вычисление барьера активации.
12. Машинное обучение в задачах дизайна биомолекул