Activity

From 01.11.2021 to 30.11.2021

15.11.2021

Avatar?id=975&size=24 01:31 Production #450: Стартовые системы
Для 2,3-фосфоглицератов заряд ставила -5, для остальных -4. Рисовала все ручками в Авогадро.
Файлы лежат в папке /ho...
Anastasia Rachkova

13.11.2021

Avatar?id=882&size=24 12:25 Production #450: Стартовые системы
Фосфорилированные остатки в поле добавил. Теперь достаточно остатку иметь нужное название и атомы фосфора и фосфориль... Alexander Zlobin

10.11.2021

Avatar?id=975&size=24 19:12 Production #450: Стартовые системы
Итоги встречи 10 ноября:
-текстовые файлы надо всегда смотреть и проверять ручками
-чтобы юзать поле, можно просто...
Anastasia Rachkova
Avatar?id=975&size=24 03:39 Production #450: Стартовые системы
PDB Burchodelii 3ezn - удалила одну из цепей, гликоли удалила, воду оставила.
*pdbfixer 3ezn_Achain.pdb --output=...
Anastasia Rachkova

03.11.2021

Avatar?id=882&size=24 13:05 Production #450: Стартовые системы
А путь-то какой к файлам? Где они лежат? Alexander Zlobin

02.11.2021

Avatar?id=975&size=24 19:10 Production #450: Стартовые системы
Сделала общий файл "3ezn_rdpg.gro" с координатами.
Потом делала ячейку и заливала ее водой:
*gmx editconf -f 3ezn_...
Anastasia Rachkova

01.11.2021

Avatar?id=975&size=24 14:25 Production #450: Стартовые системы
Спасибо! pdb сделала, двигаюсь дальше. Anastasia Rachkova
 

Also available in: Atom