Activity

From 15.10.2021 to 13.11.2021

13.11.2021

Avatar?id=882&size=24 12:25 Production #450: Стартовые системы
Фосфорилированные остатки в поле добавил. Теперь достаточно остатку иметь нужное название и атомы фосфора и фосфориль... Alexander Zlobin

10.11.2021

Avatar?id=975&size=24 19:12 Production #450: Стартовые системы
Итоги встречи 10 ноября:
-текстовые файлы надо всегда смотреть и проверять ручками
-чтобы юзать поле, можно просто...
Anastasia Rachkova
Avatar?id=975&size=24 03:39 Production #450: Стартовые системы
PDB Burchodelii 3ezn - удалила одну из цепей, гликоли удалила, воду оставила.
*pdbfixer 3ezn_Achain.pdb --output=...
Anastasia Rachkova

03.11.2021

Avatar?id=882&size=24 13:05 Production #450: Стартовые системы
А путь-то какой к файлам? Где они лежат? Alexander Zlobin

02.11.2021

Avatar?id=975&size=24 19:10 Production #450: Стартовые системы
Сделала общий файл "3ezn_rdpg.gro" с координатами.
Потом делала ячейку и заливала ее водой:
*gmx editconf -f 3ezn_...
Anastasia Rachkova

01.11.2021

Avatar?id=975&size=24 14:25 Production #450: Стартовые системы
Спасибо! pdb сделала, двигаюсь дальше. Anastasia Rachkova

31.10.2021

Avatar?id=882&size=24 17:51 Production #450: Стартовые системы
Режим editing в Pymol
Ctrl + ПКМ, щелчок по связи и зажать - будет вращение той группы, к которой ближе вы щелкнули.
Alexander Zlobin
Avatar?id=975&size=24 03:06 Production #450: Стартовые системы
У меня какой-то фейл с тем, чтобы вращать остатки амидов, делаю это не по-русски. Вы не подскажете еще раз, пожалуйст... Anastasia Rachkova

28.10.2021

Avatar?id=882&size=24 09:48 Production #450: Стартовые системы
Подготовка корректных систем - половина успешности моделирования, так что да, каким бы ни было унылым, делать приходи... Alexander Zlobin

27.10.2021

Avatar?id=975&size=24 01:21 Production #450: Стартовые системы
У меня небыстро продвигается с ручной обработкой гистидинов и аспарагинов с глутаминами. Хочу к 30 ноября доделать на... Anastasia Rachkova
Avatar?id=882&size=24 12:24 Production #450: Стартовые системы
Привет, апдейтни по подготовке систем, пожалуйста. Когда смогу их посмотреть и обсудить?
И следи за своевременным об...
Alexander Zlobin
 

Also available in: Atom